В природе прорастание семян можжевельников связано с прохождением их через желудок-кишечник птиц, так что без соответствующей обработки не прорастут.
Самый простой вариант, хоть и не такой интересный - это приобрести можжевельник на рынке. Рыночные растения гораздо проще переносят пересадку, чем "дикие".